Les échanges commerciaux sintensifient et sétendent à lensemble de la planète. La détermination de l'origine géographique est une exigence du système de traçabilité lors de l'importation-exportation des produits. La difficulté de mise en place de systèmes documentaires dans les pays en développement, crée un besoin des nouvelles stratégies de traçabilité. Lidée de créer un 'code barre biologique' basé sur lanalyse des ADN de microorganismes présents sur les fruits est une piste intéressante. Cette méthode repose sur lhypothèse que la microflore commensale (levures et moisissures) des fruits de Karité et du Physalis est spécifique dune zone géographique de production. Le principal résultat est que les profils des ADNs des levures ou des moisissures des fruits obtenus par PCR-DGGE, peuvent être reliés à leur lorigine géographique. Les différences environnementales des lieux de récolte des fruits ont un effet majeur sur l'écologie des levures et des moisissures. Le facteur prédominant sur le contenu microbien pour une zone géographique donnée est la pluviométrie. Les marqueurs que sont les levures ou les moisissures sont pérennes au cours de la saison de récolte.

Aly Farag El Sheikha est chercheur en écologie microbienne au CIRAD. Titulaire d'un doctorat de biotechnologie et microbiologie de l'Université Montpellier II en 2010, il s'est spécialisé dans les méthodes moléculaires utilisées en traçabilité afin de déterminer les origines géographiques.

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